Das LUA ist die Fachaufsichtsbehörde über die Kreisverwaltungen und Kreisfreien Städte unter anderem für die Tierseuchenbekämpfung, den Tierschutz und die Beseitigung und Verarbeitung tierischer Nebenprodukte (vorher: Tierkörperbeseitigung).

Das LUA plant und koordiniert die Bekämpfung von Tierseuchen, zum Beispiel die Impfung von Wildschweinen gegen die Schweinepest oder die Impfung von Füchsen gegen die Fuchstollwut.
Beim Ausbruch von Tierseuchen wird im LUA das regionale Krisenzentrum eingerichtet.

Weitere Aufgaben des Referats Tierseuchenbekämpfung, Tierschutz, tierische Nebenprodukte sind:

• die Genehmigung von Tierversuchen,
• die Überwachung von Tierkörperbeseitigungsanstalten,
• die veterinärhygienische Überwachung von Besamungsstationen.